应在报销、应付、入账等系统之间统一发票唯一标识，并记录发票已关联的业务单、报销单和凭证。校验不能只比较文件名或图片，还要比较发票号码等关键字段，并区分重复提交与一票分摊。慧穗发票池及入账接口可参与状态同步，跨系统拦截规则需要结合企业业务配置。

实务中，一张发票可能先在员工报销系统出现，又从税务数字账户归集进发票池。因此去重应覆盖多入口，并保留首次来源、后续状态变化和各业务使用记录。发现重复时可以阻止第二次付款或入账，同时允许有依据的费用分摊与冲销。